Có 43 đội đăng ký tham gia, 3 đội đạt thứ hạng cao tại giải này sẽ được đặc cách tham gia vòng chung kết Giải Bóng đá Sinh viên toàn quốc 2006 diễn ra tại Hà Nội. Giải có tổng giá trị tiền thưởng là 70 triệu đồng, trong đó đội vô địch được nhận 30 triệu đồng. Trận khai mạc vào ngày 24 –2 trên sân Thống Nhất (ĐH Bách khoa gặp ĐH Y Dược) được VTV truyền hình trực tiếp.
